1900年农历五月二十六日，王道士偶然发现了一个秘密洞窟。这个石窟就是敦煌莫高窟。令唐史学家没有想到的是，在敦煌残卷中竟然透露出了黄巢死因的蛛丝马迹。
敦煌文书里有一件《肃州报告》黄巢战败等情况残卷，写道：其草贼黄巢被尚让杀却，于西川进头。公元884年5月，黄巢在今河南中牟西，遭沙陀骑兵突袭，牺牲万余人。在此危急关头，尚让却率万人投降唐廷。
有推测，尚让很可能在混战之中将黄巢杀死。这个战报被立即飞报朝廷和作战军队，这一情节就被记载在《肃州报告黄巢战败等情况残卷》中。
各类记载针锋相对：或者黄巢逃过一劫？
唐代学者崔致远所著的《桂苑笔耕录》中记载的信息说明，唐将时溥是引诱黄巢起义军当中投降的将领把黄巢杀死的。
令人疑惑的是，如果当时有人杀死黄巢，必定立下大功。即便是作为帮凶，其名字也会名扬四海，并为各种史书所记载。但关于尚让杀黄巢的说法，在迄今发现的史料中的记载只有一处。
在宋朝邵博的《河南邵氏闻见后录》卷十七中曾经提到，若说杀黄巢于狼虎谷，献首于徐州，两地相距约五六百华里，快马也要三天路程，而徐州至成都马不停蹄，日夜兼程，也需二十天。当时又值盛暑，“函首”恐怕早已腐臭不堪了，更何况黄巢兄弟六七人，难言其中就没有与黄巢状貌类似者。
如此看来，很有可能在狼虎谷中被林言杀死的只是黄巢的替身。
宋人刘是之的《刘氏杂志》中有这样的记载，五代时有一个高僧法号翠微禅师，这个人就是黄巢。更为传奇的是张端义在《贵耳集》中记载说，“黄巢后为缁徒，曾主大刹，禅道为丛林推重，临入寂时，指脚下有黄巢两字”。
在这些史料中，虽然黄巢起义军在山东狼虎谷几乎全军覆没，但此时黄巢并未身死，他用金蝉脱壳之计瞒过唐朝追兵的眼睛，在逃出狼虎谷的残军中依然有黄巢的身影。