双方就这样剑拔弩张地对峙了三天，对于士气低落的汉军来说，这几天相当难熬。元璋决定先静观其变，果然，到了第三天夜里，陈友谅的左、右二金吾将军a皆率所部来降。
在此之前，陈友谅与属下商量对策时，其右金吾将军进言：“既然如今水战不胜，想要出湖又很不容易，不如我等焚舟登陆，直趋鄱阳湖南部地区，以再图发展。也可杀向吉安，在熊天瑞掩护下返回武昌！”
左金吾将军则道：“如今我部虽然数战不利，但我部兵力甚众，尚堪一战。若继续拼斗下去，我部未必就会失败，怎么可以自焚船只向敌人示弱呢？再说万一舍舟登陆，敌人派步骑兵追杀，我部进退失据，性命都难保，还谈什么将来？”
陈友谅犹豫了好一阵子，想到几次交手下来，都是败多胜少，再打下去，前景似乎很渺茫。他又悄悄询问张定边的意见，张定边只得老实说道：“如今我部水师已丧失优势，士气有所不振，欲图再战，多有不利！而今且不如先保存实力，回武昌后再说。若从湖口突围，那时势必有一番恶斗，家属们恐怕会遭殃！不如我们做出从湖口突围的架势，转而南向登陆，迅速向吉安挺进，那时敌人的步骑兵也来不及追赶！”
陈友谅最后采纳了右金吾将军和张定边的建议，要大家布置下去。
左金吾将军见状，觉得大势已去，于是率领部下偷偷来到元璋处请降；左金吾将军带走了约三万人马，还没容陈友谅做出举措防止同类事件发生，右金吾将军因对前途越发没有信心，也领着麾下的两万多人马来到元璋处请降。此时，连同十余万伤残士兵及二十万家属，陈部尚有不足四十万众。
a 陈友谅国号为“大汉”，所以恢复的也是汉代的官衔，此处“金吾将军”就是指他的亲军将领。
两员亲信大将带着皇帝的亲军先后投敌，这对陈部的打击无疑是致命的，众将已基本无心再战了，都在偷偷考虑自己的后路。而且由于两名金吾将军把汉军的转进路线也告知了敌方，汉军在兵力上又已大损，还带着那么多家属，所以原有的计划已经行不通了。
一时之间，汉军上下又陷入了焦虑和踌躇中，元璋见陈友谅久不出战，便口述了一封极尽挖苦、讽刺之能事的书信，想要激怒他，内容如下：
方今取天下之势，同讨夷狄，以安中国，是为上策；结怨中国，而后夷狄，是谓无策。
曩者，公犯池州，吾不以为嫌，生还俘虏，将欲与公为约从之举，各安一方，以俟天命，此吾之本心也。公失此计，乃先与我为仇，我是以破公江州，遂蹂蕲、黄、汉、沔之地，因举龙兴十一郡，奄为我有。
今又不悔，复启兵端，既困于洪都，两败于康山，杀其弟侄，残其兵将，损数万之命，无尺寸之功，此逆天理、悖人心之所致也！
公乘尾大不掉之舟，顿兵敝甲，与吾相持，以公平日之狂暴，正当亲决一战，何徐徐随后，若听吾指挥者，无乃非丈夫乎？公早决之。
看罢书信，陈友谅难掩狂怒之情，胸口一时间感觉有些梗塞，他当即撕毁书信，并扣留了使者。
好在陈友谅的头脑还保持着一丝清明，不断提醒自己万万不可意气用事。他转念一想，不如将计就计，故作姿态，先做出决战的架势。为表决心，陈友谅在大营中竖起了金字大旗，来回巡视水寨，还命令将俘虏的朱部士卒一律处死！
暗地里，陈友谅则伺机部署突围事宜，可是，如何突围呢？这又令他及张定边等人颇为踌躇，最后还是只能静观其变。
元璋得知了汉军方面的消息后，不仅没有进行报复，还反其道而行之，不仅为被俘虏的汉军士兵疗伤，而且将他们一概释放，并下令：“今后再俘虏敌军，一律不要杀！”为了进一步收取人心、瓦解汉军的斗志，朱元璋还下令祭拜汉军战死的将士。
时间就在对峙中一天天过去，这天，深谙水战的俞通海突然向元璋建议道：“汉虏言战而不战，看来还是想突围，我部应该扼住长江上流，因为湖水太浅，船只容易搁浅，不利于阻止汉虏突围！”
刘基也建议道：“陈友谅恐怕还是会冒险突围，这样用船也快些，一旦得逞，他就无后顾之忧了。我部主力当移师湖口，到那里守株待兔，等着陈友谅送上门来！”
“那南面呢？”元璋问道。
刘基捋了捋长须，笑道：“除继续进行监视外，南面布置几支骚扰部队即可，若他真敢弃舟登岸，我部再行围追堵截不迟！他那边带着家属，跑不快的！”
“先生想得周到，那就这样办吧！”元璋欣然道，“最后的时刻就要到了啊，如果陈友谅冲出湖去，那我部要断行追击，绝不给他以喘息之机！”
陈友谅一看这个架势，赶忙来向张定边讨主意，张定边只是决绝道：“现在想全身而退肯定是不可能了，只能强行突围，硬撞也要撞出一条血路来！”
陈友谅不无悔意地说道：“早知今日，何必当初啊，当初就不该带这么些家属来，如今倒成了累赘！”他更后悔把他的阿娇带来了，竟真的让她成了拖累楚霸王的“虞姬”。
“事已至此，悔也无益，一切皆是天命！”张定边以平静的语气说道，“此番我等若全然回到武昌，彼等必穷追拦截，我等须以巨舰载石后凿沉，以封堵长江水道，为部署守城争取时间为上！”
朱家军出湖口后，元璋即命常遇春、廖永忠等人率领水师横截于湖面，张开罗网，迎候汉军于归路之上，又令一军立栅栏于岸上，便于彼此呼应。
朱家军布防于湖口已经有五天了，但是陈友谅仍旧不敢出战。于是元璋又命人写了封信给陈友谅，这一次语气缓和了许多，意在占据一种道义制高点，内容是：
昨兵船对泊潴矶，尝遣使赍记事往，不睹使回，公度量何浅浅哉？大丈夫谋天下，何有深仇？
夫辛卯以来，天下豪杰纷然并起，迩来中原英雄，兴问罪之师，挟天子令诸侯，于是**虐之徒，一扫而亡！公之湘阴刘亦惧而往，此公腹心人也，部下将自此往矣！
江淮英雄，唯存吾与公耳，何乃自相吞并，公今战亡弟侄、首将，又何怒焉！公之土地吾已得之，纵力驱残兵来死城下，不可再得也。设使公侥幸逃还，亦宜修德，勿作欺人之寇，却帝名而待真主，不然丧家灭姓，悔之晚矣！
陈友谅看了元璋来信，深恨天命不在己，自古成王败寇，将来青史上该怎么书写自己呢？他又怒又悔，也无心回复元璋。
对于陈友谅的残部，朱部已呈关门打狗之势，胜券在握。此刻的元璋心情舒畅，逸兴遄飞，于是他与博士夏煜等登临送目于观音阁。观音阁是白莲教活动的一个重要据点，因为投靠了小明王，所以元璋等人也在表面上接受了白莲教的信仰和仪式，专程赶到这里祭祀了一番。
待到祭祀完毕，意兴正浓的元璋特意题写下了一首诗：
一色山河两国争，是谁有福是谁倾。
我来觅迹观音阁，唯有苍穹造化宏。
抒情过后，元璋意气弥壮，遣裨将率兵长驱湖广蕲州及江西兴国，不仅将两地攻克，还缴获了十余艘大小船只。
自从四月份以来，陈家军水师在鄱阳湖已经度过了上百天，携带的军粮所剩无几，为了缓解燃眉之急，陈友谅只得出动五百余艘战船，前往位于湖区北岸的都昌一带抢粮。
坐镇洪都的朱文正得知这个消息后，立即派人到都昌一带潜伏，伺机放火焚烧陈家军的运粮船只。结果陈友谅不仅粮食没有弄到，船只还被烧了不少，形势愈加交困了。
坐吃山空的日子是维持不了多久的，八月二十五日夜间，陈友谅找到达氏，拉着她的手说道：“阿娇，刚才朕已经同定边兄他们商议了，明天就要突围！”
达氏心里一慌，有些不知所措的样子，许久，她试着让自己镇静下来，可作为一个弱女子，她的心还是不免突突地跳，如揣了一只小兔子般。她下定了决心，扑入陈友谅怀里道：“那上位，就让我追随在你身边吧，生生死死我都跟你在一起！”
“不行，太危险，你还是随同家属在后面吧！”陈友谅搂紧了她说道，“此番突围必是一番死斗，朕把你带在身边不方便！”
达氏不禁流下泪来，她还是坚持道：“那我躲在船舱里就行，绝不会给上位添麻烦！”
陈友谅看到她可怜的模样，顿起怜惜之心，也越发憎恨自己的无能，遂微笑着安慰道：“躲在船舱里也不行啊，一旦船只受损严重，我们就得换船，那你说，我们如果带着你，还方便吗……阿娇听话，你就跟着罗复仁他们在后面就行，这一次我要亲自去杀出一条血路来！放心，只要我陈友谅有一口气，就绝不会丢弃大伙的，更不会丢弃你的！”
“那我不管，我就跟在上位身边！生死都在一处！”达氏心里更多的其实还是恐惧，她最信服陈友谅一个人的力量。
陈友谅一生最喜欢自比楚霸王，也每每自以为可以超越项羽，可是没有想到，自己还是没能冲破宿命，将来的青史上，难说不把自己视为“项羽第二”！无疑，阿娇就是她的虞姬，垓下之围时，虞姬为免拖累霸王而情愿自戕，若是此时的阿娇也上演那么一出，自己是该高兴还是悲伤呢？虞姬自戕了，所以霸王成功突围了，可是如果虞姬没有自戕呢？
陈友谅不敢想下去了，无论如何他还是不愿服输，他既不能失去江山，也不能失去美人，只是竭力说服着他的阿娇。两个人相拥着、絮语着，直到半夜才睡去，这一晚真是既漫长，又短暂。
次日，陈友谅醒来后，达氏也随同起身伺候他穿衣。陈友谅发现达氏的眼睛红肿着，看她疲倦的神情，陈友谅晓得她定然是一夜未眠，忙关切地问道：“你这样怎么行呢？今天可是非常的日子，快别胡思乱想了，赶紧再去睡一会儿吧！”
待陈友谅穿好了衣服要出去时，达氏突然哀戚着说道：“上位放心，万一被俘，我绝不会受辱的！”
“好！”陈友谅举了举手上的宝剑道，“朕也告诉你，除非朕死，否则谁也别想俘虏朕的女人！”
两人最后诀别时，陈友谅给了她一把可以袖藏的精致匕首，然后头也不回地走了，留下一阵阵让人悲感的秋风……
二十六日这天，穷蹙已极的汉军开始全力突围，陈友谅亲率前军，张定边统领后军，家属们大致处于中间位置。
陈友谅首先选择的突围地点在湖口西面的南湖觜，但这里是朱家军重点设防的区域，汉军前锋在这里遭到了朱家军将士的有力阻击，激战了整个上午，汉军一直未能突破。无奈之下，陈友谅又改去湖口方向突围。
元璋见状，于是亲自指挥诸将进行全力阻击，双方舰队没一会儿就紧紧地纠缠在了一起，拼命厮打着顺水进入了长江。从中午又战至黄昏，双方仍然难解难分，船队一直被冲到了泾江口，驻扎在那里的朱家军立刻发炮，予敌以迎头痛击。
汉军仍在做困兽之斗，但面对朱家军的强力封锁与四面围攻，情形不容乐观。此时天色已经暗了下来，汉军利用夜色突围的概率还是很大的。然而，一件谁也没有料到的偶发性大事却临头了——夜幕时分，突然有一批降卒要求见元璋，他们声称“陈伪主已死”！
元璋赶紧召见了他们，一名了解内情的陈友谅亲兵禀告道：“……只因我们的大船受损严重，陈伪主便带着我们十几个人换乘小船，准备转移到另一艘大船上。可就在这时，贵部突然朝我们万箭齐发，流矢正巧射中了陈伪主的一只眼睛，他当场被利箭贯穿头颅而死！”
元璋还有些疑问，道：“陈友谅英雄一世，为何这么不小心呢？”
那亲兵答道：“近来陈伪主意气甚是消沉，大约是太分神了，何况天色又很晚了，哪里看得清！当然，也是贵部弓箭手神勇，我们一行十几人大概就活了我一个！”
“那尸体和首级呢？为什么没有带来？”元璋高声问道。
那亲兵忙跪下去说道：“只因当时小的心里太慌，只顾着逃命了，小的不敢撒谎，陈伪主千真万确已死，不信明公接下来看！”
起初，元璋还有些将信将疑，但看汉军的气势越发不振，元璋于是命人向全军通传了这条天大的喜讯，朱部将士闻之雀跃，于是杀敌益奋！就这样，在彻夜的混战中，朱家军一举生擒了大汉太子陈善、平章姚天祥等人，以及罗复仁和达氏等部分家属。
第二天，见大势已去的陈汉平章陈荣、参政鲁某、枢密使李才等大小官员，带领全军五万余人来降。只有太尉张定边及杨丞相等人，乘夜以小舟装着陈友谅的尸首及其子陈理，经过一番苦战，在岳州张必先派出的援军接应下，总算顺利冲出了包围圈，逃回了武昌。
当初从武昌出发时，连将士带百官和家属约计六十万之众，可最终能够回到武昌的却只有区区五六万人，一场史上空前未有的大水战，就这样以朱部的完胜落下了帷幕……