自从百济被灭之后，一向不服软的高句丽也有点儿恐慌，老实了不少。高宗封禅泰山时，高句丽王高藏也派来了太子福男参加仪式。
就在封泰山这年，即乾封元年，东边的高句丽有了新情况，天赐给大唐一个良机！
乾封元年（666年）五月，高句丽的权臣、“莫离支”渊盖苏文终于伸腿瞪眼见了阎王。“莫离支”不是国王，是握有实权的渊盖苏文自设的一种最高官职，类似于曹操。他在接班人问题上没处理好，他一死，高句丽就发生了内乱。
按照嫡长子继承制，渊盖苏文的长子渊男生接任了莫离支。此人还比较敬业，为了显示实力，决定出巡实际控制区。把弟弟男建、男产留在都城代理朝政。
男生一走，有人就挑拨他们兄弟之间的关系，对留守都城的这两人说：“你们哥哥怕你俩夺他的位，想找机会除掉你们。”两人还不太相信。于是又有人对渊男生说：“你的两个兄弟想夺你的权，要趁你出外的机会让你变成丧家之犬。”
这个挑拨离间的人是谁呢？本着谁受益谁犯罪的原则，可能就是高句丽王高藏。
他的挑拨做哥哥的信了，渊男生马上遣亲信到平壤去打探虚实，疑心生暗鬼，于是乎顺理成章了，这就成了哥哥要收拾弟弟的证据！
留守的兄弟得知消息后想马上遣人召兄长回来，想解释清楚。渊男生哪敢回去自投罗网？渊男建被逼无奈，只好真的叛乱，自立为莫离支，派兵讨伐他哥哥。结果，正宗的莫离支渊男生反倒不敢回都城了，只能别走他城。做弟弟的咄咄逼人，做哥哥的也不能束手待毙，可是渊男生一没兵二没将，想打都打不成器。
可是哪能甘心呀！一咬牙，渊男生派儿子泉献诚（前文说过，为避讳李渊的名字，他们家的姓由“渊”变“泉”，只是习惯说法还叫“渊”。只不过这孩子此后大半生都在唐朝度过，所以习惯上叫泉献城）以超越马拉松长跑的毅力跑到长安，向唐高宗求救！
这机会千载难逢！高宗和武后经过商议，决定发大军征讨高句丽。这次的战略意图非常明确——平了这个东方宿敌。
乾封元年（666年）六月七日，武则天命令右骁卫大将军契苾何力为辽东道安抚大使，右金吾卫将军庞同善、营州都督高侃为行军总管，以渊献诚为右武卫将军，做唐军的向导。
唐军一入境，被夺了位的渊男生见救星来了，立刻来了精神，准备率部汇合。唐廷让他做了辽东大都督。
到了十二月，高宗、武后觉得战事进展还不够快，便又任命老将军李勣为辽东道行军大总管，郝处俊（此人在男宠一节中还有重头戏）为副大总管，带领薛仁贵等将领率援军投入战场。先前的各军，也都全归李勣节制。
李勣已是七十六岁的老将，他也决定在有生之年为国立最后一功。
唐军渡过辽水后，庞同善、高侃分两路并进，薛仁贵带着一支人马专打游动战，策应各军。
他率部直抵高句丽新城，此城乃高句丽西部重要据点。他命军队登上城厢高山，俯瞰发箭，城守军官惧怕，开城投降。李勣留下契苾何力（契苾何力是铁勒人，后附唐朝。因为是唐朝的女婿，且一直战功卓著，所以唐人对他是绝对信任）驻守新城。他本人催军急进。这次唐军气势相当凶猛。仗打了一年，一连拿下了高句丽十六城。
薛仁贵在攻占城镇时尤为骁勇，战功卓著。
渊男建不服输，企图派兵偷袭，结果被薛仁贵一部中途伏击，大败之。高侃率军行至金山，遇到高句丽兵据险防守，打得不顺手，随后向北撤退。高句丽士兵离开险地，纵兵穷追，结果又被薛仁贵拦腰截杀。
另外一路郭待封率领水军开赴平壤，李勣派别将冯师本载着粮草辎重去支援他，没想到冯师本没能在约定时间赶到，郭待封的军队缺乏食物。他想给李勣写信催粮，又怕被高句丽人截获得知虚实，于是写了一首藏头诗给李勣。李勣是个武人，哪看得懂，骂道：“军事如此之急，居然还有心情写诗？我定要军法从事！”幸亏行军管记通事舍人元万顷向李勣解释了这首诗的意思，李勣才另行派人给郭待封送去粮草。
这位会猜谜的元万顷也算是个活宝，他为了做好部队的政治宣传工作，写了一篇《檄高句丽文》，中间有一句：“不知守鸭绿之险。”渊男建回书说：“谨受命！”于是命军队守住鸭绿江，唐兵因此不得渡。高宗听说后大怒，把元万顷流放到岭南。
另一边高侃的军队就打得不怎么样了，他中了渊男建的袭击，被打败，逃到金山，又打了败仗。
高句丽军队继续追击，薛仁贵引兵伏击，打得高句丽军队大败而逃。唐军趁热打铁，攻下南苏、木底、苍岩三城，与渊男生合兵一处。
金山得胜之后，总章元年（668年）年初，薛仁贵又统兵三千，直扑扶余城。
诸将认为这点儿兵不够用，都不主张打。薛仁贵来了蛮勇的劲儿，说：“兵不在多，而在使用合度，何患少焉？”说完引兵前冲，正与赶来拦截的高句丽大军迎头相撞。一仗下来，三千猛士果然以一当十，斩俘万余人，顺势拿下了扶余城。周围四十余城闻薛仁贵之名，尽开城请降。
这次战争，唐军打得实在漂亮。高句丽方面本应该步步据守，还像过去那样打守城战、持久战。但是几次大的战斗，他们都是倚仗人多，与唐军展开野战，当然没有好果子吃。
李勣见取得了决定性的胜利，捋着胡子笑了，派随军侍御史贾言忠回京告捷。
高宗见了贾言忠，问他进展如何。贾言忠说：“高句丽必平。”
高宗大喜，问道：“卿何以知之？”
贾言忠便不慌不忙说出一番道理来：“隋炀帝东征而不克者，人心离散也；先帝东征而不克者，高句丽未乱，无隙可乘也。今高句丽王微弱，权臣擅命，盖苏文一死，男建兄弟相攻，男生内附大唐，为我向导，彼方情形，无不知之。以陛下圣明，国家富强，将士尽力，以乘高句丽之乱，其势必克，无须费力矣。且高句丽连年饥馑，人心危骇，其亡可跷足待也。”
高宗一听此话当然大喜，又问他对诸将的评价，贾言忠一一道来：“薛仁贵勇冠三军；庞同善虽不善斗，而将军严整；高侃勤俭自处，忠果有谋；契苾何力沉毅能断，虽颇忌前，而有统御之才；然夙夜小心，忘身忧国，皆莫及李勣也。”
高宗、武后对贾言忠的分析评价大为满意，深以为然。
总章元年（668年）七月底，唐军拿下扶余后，高句丽方面又犯昏，西拼东凑派了五万兵来，企图夺回扶余。
又是一场野战！李勣奋力迎击，大破之，狂追二百里，汇合诸路军，直抵平壤城下。围困了一个月后，渊男产率各部首领举白幡投降，李勣以礼相待。
但是死硬派渊男建仍是不降，闭门拒守，还派兵出战。他把军事委托给一个和尚信诚来管，但这个和尚却暗中派人与李勣联络，以为内应。九月十二日，信诚和尚大开城门，李勣纵兵登城鼓噪，焚城四角。渊男建见大势已去，欲举刀自尽，恰好被唐军擒住，未遂。
就这样，立国七百余年的高句丽终于灭亡。高宗与武后完成了隋唐两朝两代天子的夙愿。
总章元年（668年）十月，李勣带领大军凯旋归来，军中奏起破阵乐，沿途百姓夹道欢迎，欢歌颂舞，其中包括十几万请求内附的原高句丽国民。
十二月，高宗、武后在龙首山的蓬莱宫含元殿举行了受降仪式，都按照政策做了处理：赦免了高句丽傀儡国王高藏，封为司平（龙朔二年，即662年，改工部为“司平”）太常伯员外，养老送终；先后归附的泉氏两个兄弟都封了大唐的官职；抵抗者渊男建按大唐罪臣待遇流放黔中；其余高句丽官员，分别派任为各地都督、刺史、县令等官员，正式成为唐朝的官吏。
平辽将领也各有封赏，尤以大功臣李勣为最，加封太子太师。
整个高句丽，也都已收入大唐版图。统属安东都护府管辖。
安东都护，由大名鼎鼎的薛仁贵担任，领兵二万镇抚之。并封为济右威卫大将军，平阳郡公。据说，当时高句丽人只要说一声“薛礼（名礼，字仁贵）来了”，家中小儿马上就会止住啼哭。将军的赫赫威名，甚至流传千年不衰。
以七十六岁高龄统率征东大军的李勣，总章二年（669年）十二月一病不起，高宗把他所有在外当官的子侄都召了回来侍疾。高宗和太子赐的药物，李勣只是随便吃了一点，对于子弟们请来的医药，李勣都不服用。他知道自己的病已经不能够好，便对弟弟司卫少卿李弼说：“我今天感觉好些了，把所有的家人叫来，喝酒为乐。”
等子侄们都到了，李勣当着他们对李弼说：“我今天与你们诀别了。你们不需要伤心，听我约束。我看到房玄龄、杜如晦平生勤苦，一旦出了个不肖之子，家族就会倾覆。我现在把我的子孙们托付给你，如果他们当中有不肖子孙，你可以先把他们杀掉，以免后患。”说完这些话没几天，李勣就去世了，终年七十九岁。
李勣是从武德年间就开始建功立业的，从江洋大盗，做到了堂堂宰相，堪称传奇。
他回首早年经历时，曾颇为风趣地说：“我十余岁作贼，是逢人必杀的无赖贼；十四五岁是难当贼，不高兴就杀人；十七八岁是佳贼，临阵才杀人；二十岁时为大将，用兵救人不死。”这个瓦岗寨的好汉徐懋功，终于修成了正果！
老将军去世后，高宗、武后异常悲痛，诏令以特殊功勋陪葬太宗昭陵，封其坟丘如阴山、铁山、乌德鞬山的模样，纪念他挂帅远征的大战役。追赠李勣为太尉，由于李勣的长子李震早已经去世，让他的孙子徐敬业（听着耳熟吧，后文还有故事）袭承英国公爵位。